Es la precuela del anime Choujikuu Yousai Macross. La historia se desarrolla 9 años después de la caída de una nave alienígena en la tierra (SDF-1 Macross) y un año antes de la primera guerra contra los Zentraedi. La trama se centra en un joven de nombre Shin Kud?, piloto de un F-14 de la U.N, cuyo avión es derribado por un misterioso caza, con la capacidad de transformarse en un humanoide cayendo sobre una isla conocida como Mayan ahi conoce a Sara y a Mao iniciando un triangulo amoroso , junto a la lucha contra las prototipos de VF In the dark forests where the beasts roam is where one of these expert hunters, Koshi, rescues Touko from an attack by one of the creatures. But their meeting was not coincidental and he sets in motion a new destiny.
